专业能力

菌株查询实操

以 XA-PB0037 为例查询菌株、测序和分析记录,并继续进行跨菌株聚合。

体验版用户指南 V1.3 · 体验版 0.9.9

5 菌株查询实操

新录屏使用 XA-PB0037 演示单菌株追溯,并继续演示跨菌株聚合查询。查询由 strain-result-query 路由到受控菌株库服务。

5.1 发起查询

  1. 新建会话:建议一个研究主题使用一个独立会话,便于追问与复核。

  2. 写清对象与字段:示例:请使用 strain-result-query 查询 XA-PB0037 的基础信息、分析结果、送测日期、测序方式和测序参数。

  3. 发送并等待:界面显示调用的工具名与“思考中”;查询期间不要重复发送。

图 9 菌株查询:自然语言问题与工具调用状态。

5.2 阅读结果

录屏结果将测序记录与菌株基础信息分区展示,并给出 seq_id、测序类型、状态、时间和 WGS 分析流水线信息。示例中 XA-PB0037 的规范化种名为 Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420,测序类型为 hybrid。

图 10 XA-PB0037:测序记录、基础信息与分析结果汇总。

5.3 继续追问与聚合

问题类型 录屏示例 / 解释边界
代谢通路 查询丁酸相关通路或 buk2 标志物;标记只提示潜力,不等于实际产量
安全标记 查询同时命中 CARD 与 VFDB 的菌株,返回命中数用于筛查
排序聚合 按耐药性基因命中数排序,优先查看高记录数对象
科研边界 数据库命中、基因标记或功能注释不等同于实验验证。涉及表型、功效和安全性结论时,必须结合原始数据和实验复核。